GIS for biological applications – exercises

2024/25 probíhá prezenční výuka v úterý 8:10 – 10:30 učebna B12

• Předmět učíme v QGIS, zpravidla dle aktuální stabilní verze. 
  • Autorem materiálů pro QGIS je Matěj Man a Josef Brůna.
  • Zpravidla přednáší Jan Wild. 

• Texty jsou průběžně upravovány pro verzi QGIS 3.34.11 LTR.
  • Již neupravovanou verzi pro ArcGIS10 naleznete zde. 

• Aktualitu daného dokumentu poznáte podle názvu souboru. 
  • Materiály můžete využívat v souladu s licencí Creative Commons Attribution-Share Alike 3.0 Unported
    • tj. můžete je tisknout, kopírovat a upravovat, ale jen pro nekomerční účely a za podmínky, že uvedete jejich zdroj a autory.
• Pokud máte jakékoli připomínky ke cvičením a materiálům, popřípadě máte návrhy na zlepšení, napište email na: josef.bruna+gis@gmail.com
• Program se bude postupně vyvíjet podle postupu skupiny.

---

Instalace software

• https://www.qgis.org/en/site/forusers/download.html Použij OSGeo4W installer. Instaluj Express, preferenčně QGIS LTR, GRASS, GDAL. video youtube
• https://cran.r-project.org/ Instalujte verzi >= R 4.2.1
• https://rstudio.com/products/rstudio/download/ Instalace R + RStudio video youtube. 

---

1. 10. a 8.10 Úvod do QGIS

• Návod na cvičení QGIS
• Data_cv_1 – zaheslované, heslo sdělí vyučující
• Úkol: Vytvořte mapu potenciální vegetace náhodné části ČR se všemi náležitostmi (název, severka, měřítko). Zvolte vhodné barvy, aby byla mapa na první pohled čitelná. Data úkol 1  |  Jak by to mělo vypadat | Nápověda pro QGIS

---

15. 10. Projekce a import dat

• Návod na cvičení QGIS
• Data_cv_2– zaheslované, heslo sdělí vyučující
• Odkaz na web ČÚZK – národní referenční systémy
• The True Size – pomůcka na zobrazení skutečné velikosti států
• Úkol: Vytvořte mapu ČR ve 4 různých projekcích včetně pojmenování. Data pro úkol (hranice ČR) jsou v Data_cv_2

---

22. 10. Georeference

• Návod na cvičení QGIS
• Data_cv_3 data tvoří jediný soubor, *.jpg obrázek naskenované mapy. Bez hesla. 
• Tipy Pro přidání podkladových map.
• Úkol: Georeferencujte nějakou vaši mapu – oskenovanou nebo vyfocenou podle vhodného podkladu. 

---

29. 10. Vektorizace

• Návod na cvičení QGIS
• Data_cv_4 + potřebujete georeferencovanou mapu z minulého cvičení. Možno taky stáhnout zde. 
• Úkol: Vektorizujte alespoň částečně vaši rektifikovanou mapku z minulého úkolu. 

---

5. 11. Vektorová analýza I. 

• Návod na cvičení QGIS
• Data_cv_5  – vrstva geologie je rozbitá, je možné ji opravit nástrojem Fix Geometry. 
• Není úkol. 

---

12. 11. Vektorová analýza II.

• Dokončení cv5
• Není úkol

---

19.11. Digitální modely terénu

• Návod na cvičení QGIS
• Data_cv_7 Interpolace DEM z bodů a výpočty topologických parametrů.
• Není úkol

---

26.11. Rastrová analýza

• Návod na cvičení QGIS
• Data_cv_8 Raster calculator a práce se zdroji dat.
• Není úkol.

---

3.12. R jako GIS

• Návod na cvičení https://manmatej.github.io/gisproba/
• Skript na cvičení R_SKRIPT
• Úkol: Vyřešte GIS úkol v R s použitím vlastních dat. Minimální skript bude načítat SHP data a vizualizovat je. 

---

10.12. Rastrová analýza – dokončení

• Pro práci s terénními GPS Garmin doporučujeme software DNR GPS (nutno prokázat, že nejste robot)

---

17.12. Zrušeno

---

7.1. 2025 Zdroje dat

• Zdroje dat DPZ
• Zdroje dat mapy 
• GIS aplikace pro mobil 
• Úkol: Sežeňte 4 zajímavé zdroje (SHP, WMS, WFS, apod.) a zadejte do tabulky sem Pokud už daný zdroj zadal někdo před vámi, budete muset najít jiný. 
• před vámi, budete muset najít jiný.